Spin Simulation

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Spin Simulation

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注意:必须安装 NMRpredict Desktop 插件(无需该插件的许可证)。

 

MestReNova 的这一模块是用于高分辨率 NMR 图谱的高效模拟器,可通过菜单 "View/Tables/Spin Simulation(或 Prediction/Spin Simulation)"使用,该菜单将显示适用的对话框:

ABX3Y

在该对话框中,我们可以通过输入所需的值轻松模拟波谱。例如,3 个质子(3 个自旋组)分别称为 A、B 和 C,化学位移分别为 1、5 和 7 ppm。它们的耦合常数分别为 J(AB) = 3Hz、J(BC) = 5.5Hz 和 J(CA) = 3.4Hz。最后,选择点数和波谱限制,点击 "新建模拟 "按钮生成相应的波谱:

 

自旋模拟2

模拟出频谱后,您可以修改表中的任何值,并点击 "重新计算 "按钮获得新频谱 重新计算.点击 "删除 "按钮可从表格中删除特定行,或点击 "全部清除 "按钮从头开始。您可以引入 "二极性 "或 "四极性 "耦合常数,并通过点击相应方框并输入所需数值来更改 "核数目"、"自旋 "和 "线宽 "值。最后,点击 "重新计算 "按钮更新波谱中的变化。

 

点击并拖动赋值标签可更改自旋模拟波谱中任何信号的化学位移:

 

赋值拖动

 

灯泡

 

传统的自旋模拟算法仅限于 11-12 个磁性不等的耦合粒子。然而,这完全不足以解决当今的 "小分子 "问题。因此,如今的模拟需要采用全新的近似算法,例如碎片技术。

Mnova SpinSimulation 工具包就包含这种复杂的碎裂算法,可以模拟任何自旋系统,无论其大小如何。

 

 

在实验波谱上选择 "新建为叠加",将合成波谱与实验波谱叠加在一起:

 

自旋模拟叠加

 

如果实验波谱和模拟波谱的参数不一致,当您尝试以叠加方式生成计算波谱时,将显示一条 信息:

叠加自旋

点击 "是",将修改波谱属性参数,使其与实验参数一致。

自旋叠加

下面是另一个实验数据集与模拟数据集的比较示例:
 

比较

 

您可以在下面看到 "orto-dichlorobencene "的模拟波谱;这是一个 AA'BB' 系统:

 

自旋模拟4

 

如何模拟 A3BXY 系统?

下面是一个 A3BXY 系统的示例:

A3BXY_new

要得到上表,只需按照以下步骤操作:

1.首先,创建一个有 4 个自旋组的系统。请注意,A3 是一个具有 3 个等效磁自旋的唯一自旋群,因此需要在标签 A 中输入 N=3。

2.2. 然后,输入其他原子核(B、C、D)的所需值,所有原子核的 N=1 (同时输入所需的化学位移值)。请注意,Mnova 不需要知道耦合是强还是弱,因为 Mnova 是通过考虑化学位移和耦合常数的严格方法进行量子计算的 3.

3.输入所有数值并选择拉莫尔频率和数字点数量、每个原子核的线宽等之后,只需点击 "新建模拟 "按钮即可得到合成波谱。

如何添加新系统?

点击 "添加系统 "按钮 加来添加多个系统。新系统将是分子的一个片段,由于其质子不与其他质子相互作用,因此可以单独模拟。换句话说,就是一组通过耦合常数相互关联的原子核。添加新系统后,您可以使用 "种群 "编辑框更改系统的种群。

 

以丙烯酸乙酯 CH2CHCOOC2H5 这种小分子为例

 

自旋 sim3

 

如您所见,对该分子的 1H-NMR 波谱进行标准模拟需要引入八个频率,每个质子一个。此外,还需要引入九个耦合常数。不过,即使是对这个自旋系统的简单研究,也能为我们提供一个更优雅的解决方案。

 

为什么不把这个自旋系统看作两个 "子系统 "呢?一个 "子系统 "与乙基相对应,由五个质子组成,只有两个不同的频率,分别为 a(甲基)和 b(亚甲基),只有一个耦合常数 Jab。另一个 "子系统 "由剩余的三个质子(乙烯基的质子)组成,有三个频率(c、d 和 e)和三个耦合常数(Jcd、Jce 和 Jde)。将自旋系统分解为两个子系统是可能的,因为它们之间没有任何联系。自旋系统分解成子系统的过程可以在许多分子中进行,例如,这就是核磁共振波谱数据表的概念基础。

 

下面是丙烯酸乙酯的合成波谱;在创建了两个不同的系统后,系统 A(乙烯基质子)为红色,系统 B(乙基)为绿色:

 

自旋模拟5

 

这种分解方法大大提高了计算速度,因为计算的复杂性会随着所考虑的自旋(原子核)数量的增加而呈指数增长。不过,我们还可以进一步提高计算速度和灵活性。

 

为什么不只引入五个频率,并告诉程序每个频率对应多少个质子呢?引入磁性等价后,就可以使用从 a 到 e 的五个自旋组及其相应频率进行计算。前两个自旋组 a 和 b 分别有三个和两个质子,而其他三个自旋组则各有一个质子。当然,我们只需要四个耦合常数:Jab、Jcd、Jce 和 Jde。这个过程可以在许多分子中进行。