Searching in the Database |
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您可以使用相应的命令搜索 "结构"、"子结构"、"公式"、"峰值"、"倍数"、"质点"、"数字"、"文本 "等：
结构搜索 您可以通过选择 "Structure Search（结构搜索）"（将显示查询编辑器）来搜索数据库中的任 何分子结构。单击 "OK（确定）"运行搜索。
在这里，您只需选中相应的复选框，即可运行子结构搜索。
从 "立体化学 "下拉菜单中选择 "忽略 "将不会在搜索中考虑立体键。假设数据库中有 4 种化合物 RR、RS、SR 和 SS，如果搜索这 4 种化合物中的一种（即 RS），将得到 4 个搜索结果：
选择 "Absolute（绝对）"将考虑结构中存在的所有立体中心（因此，如果您搜索一个具有 RS 构型的分子，那么搜索结果将只有 RS 分子）。
而选择 "Relative（相对）"则只考虑相对立体化学，仅此而已；如果您搜索的是具有 RS 构型的分子，则 RS 和 SR 两个分子都会被命中：
点击 "Convert to advance query（转换为高级查询）"按钮可以将其转换为高级搜索，这样您就可以添加新的查询并将它们组合起来。
您还可以在 "选择显示模式 "下拉菜单中选择相应选项，以纯文本格式查看 mol 文件：
此按钮
点击 "OK（确定）"后，Mnova 将在数据库中搜索分子。
-如果数据库中没有该分子，则会显示以下信息：
-如果数据库中存储有分子结构，Mnova 将显示数据库中有关该化合物的信息。例如，假设您加载了奎宁的分子结构并选择了 "Structure Search（结构搜索）"。在这种情况下，您将看到如下窗口（最大匹配分数为 1000）：
注意：点击 "复制到数据库 "按钮，可以将结果复制到另一个数据库。单击 "重新运行查询 "按钮可以改进搜索。
单击 "重复选择 "按钮，将高亮显示重复的结果（如果有的话）。
您可以从下拉菜单中选择相应的选项，自定义重复检测功能的设置。默认情况下 ，Mnova 使用 "分子式 "字段检测重复，但您也可以使用任何其他字段组合：
点击该按钮
单击 "确定 "后会出现类似下面的窗口：
请记住，您也可以检查我们之前添加到数据库中的任何其他波谱（如 13C NMR），只需点击 "蓝色箭头"（上图中红色突出显示）即可：
您也可以双击（或右击并选择 "粘贴记录或项目到 Mnova"）将波谱或分子复制到 Mnova 文档中。
您还可以在分子结构中使用通用原子，如 R（任何链，H、D 和 T 除外）、Z（任何链，包括 H、D 和 T）、A（任何原子，H、D 和 T 除外）、X（任何卤素）、Ht（任何杂原子）。例如，要搜索醇或胺，请画出相应的基团（以及您希望结果包含的任何其他基团），添加 Zs（Z-NH2、Z-OH），然后进行结构搜索。
下面是一个查找含 C=C 双键化合物的示例：
例如，如果您想查找至少含有四个 C=C 双键的化合物，可以画出下面的图：
如果要搜索酮类化合物，可以画出以下分子结构：
子结构搜索 子结构搜索功能用于通过化学结构查找产品。只需复制一个结构片段，点击右键并选择 "子结构搜索 "即可：
在这种情况下，我们获得了 5 条搜索结果（记录 24、25、48、68 和 70）：
您也可以在分子结构中使用通用原子，如 R（任何链，H、D 和 T 除外）、Z（任何链，包括 H、D 和 T）、A（任何原子，H、D 和 T 除外）、X（任何卤素）、Ht（任何杂原子）。例如，要搜索醇或胺，请绘制相应的基团（以及您希望结果包含的任何其他基团），添加 Zs（Z-NH2、Z-OH），然后进行子结构搜索。
配方搜索 该功能允许您搜索数据库中的任何特定分子式。为此，只需在 "编辑框 "中键入分子式，然后点击 "确定 "即可。您可以使用 "ItemType（项目类型）"和 "Field（字段）"选项对搜索进行限制（非强制性）：
分子式搜索的格式非常灵活。下面举例说明：
如果输入： C1,4 H3,8 N1,1; ，程序将搜索含有 1 至 4 个碳原子、3 至 8 个氢原子和正好一个 N 的分子结构；其他元素可以搜索，但不是必须的。注意空格可以省略。
-元素可以用小写，但不能有 2 个没有空格的元素，因此 "c1,4h3,8n1,1 "可以，而 "c4,7no "不行，因为 "no "会被理解为 "否"。
-范围可以省略，因此 "C "等同于 "C1,1"，"C3 "等同于 "C3,3"，"C,4 "等同于 "C1,4"，"C2, "等同于 "C2,∞"。
-元符号 "HT "可用于表示杂原子，"X "表示卤素，"!"（感叹号）位于式子末尾，表示只允许使用指定的元素。因此，"C1,4 Ht3 "可搜索 1 至 4 个碳原子和正好 3 个杂质原子，而 "C3,5 H6,10!"可搜索 3 至 5 个 C 和 6 至 10 个 H 的碳氢化合物。
质量搜索 此功能可让您在数据库中（使用余弦法）搜索分子式的质量值，并可选择范围和质量类型（平均质量、单异质量、精确质量或分子量）。
峰值搜索 如果您在 Mnova 中加载了波谱（这不是强制性的），并选择 "数据库/核磁共振搜索/峰值搜索"（或右键单击/峰值搜索），应用程序将在数据库中查找这些峰值。如果您扩展了波谱的任何区域，则只会搜索扩展区域的峰值（而不是整个波谱）。请注意，如果您忘记对扩展区域进行选峰，Mnova 将（通过自动选峰）进行选峰。
选择峰值搜索功能后，将显示查询编辑器对话框：
点击 "转换为高级查询 "按钮
在上面的对话框中，您会发现一个带有不同按钮的工具栏：
-选择显示模式：可以显示峰值表或频谱预览。 -峰值：显示扩展区域的 "全范围 "或仅 "可见范围 -按化合物选择峰值：仅搜索某些特定化合物的峰值 -添加/删除：从表中添加或删除峰 -化合物/混合物/纯度/相似度：
峰和多体搜索对话框有一个工具按钮，用于更改搜索模式。默认模式为 "化合物"，会对查询中存在但 db 波谱中没有的峰进行惩罚。默认模式可以在用户偏好设置中进行设置。
使用 "化合物搜索 "进行评分时，假定样品是一个化合物，并根据存储波谱与总查询的匹配程度进行评分。 得分（化合物）=1000*[查询中匹配的峰数/查询波谱中的总峰数］ 查询中存在但存储波谱中没有的峰或多峰将计入得分。这种方法对于主要由单一化合物组成的波谱效果很好，但在对混合样品进行搜索时，可能会出现问题和过多的 "坏 "命中。对于二元、三元等类型的混合物，另一种有用的方法是 "含量 "评分，即根据任何潜在的命中点的峰值与查询波谱的对比情况进行评分。要获得 "含量 "得分 "1000"，存储波谱中的所有峰值都必须出现在查询波谱中，但查询波谱中的额外峰值不会受到惩罚。这几乎是波谱的反向分级
例如如果化合物 A 和化合物 B 的混合比例约为 50:50，运行查询后，如果使用传统的评分方法，两种化合物的得分约为 "500 "分。如果额外显示上述建议的评分方法，则每个存储的波谱都将获得 "1000 "分的 "内容 "等级。这种评分方法可以更好地显示分析样品中是否存在特定化合物。这还有助于彻底排除那些在传统评分方法中得分较低，但在评分中却因多重谱点/峰的巧合重叠而出现的化合物。
混合物意味着查询谱图中的峰值将被忽略，但库谱图中的峰值不会被忽略。 得分（混合）= 1000*[数据库波谱中匹配的峰数/数据库波谱中的峰总数］ 这适用于查询波谱可能是含有其他化合物的混合物，而数据库是用纯化合物建立的情况。它将对数据库谱图中有而查询谱图中没有的峰进行惩罚。
纯度搜索：数据库中不纯净的波谱（包含许多杂散峰）将获得较低的搜索分数。 得分（纯度）= 1000*[查询中匹配的峰数/[（查询波谱中的总峰数 + 数据库波谱中的总峰数）/2 ]]。
相似性：通过比较曲线后面的面积来搜索一维波谱的智能算法。
-参数：设置峰搜索方法（化合物、混合物、纯度或相似性），以及结果、过滤器和公差的 一些设置：
查询格式 "可以是传统格式、JSON 格式或混合格式： 传统格式：用于以简单线条为导向的简单峰值搜索请求。 要搜索的峰值数量，然后每行一个峰值 JSON：用于 JSON 格式的简单峰值搜索请求。MnServer <r420 仅理解传统格式。MnServer >r420 可理解传统格式和 JSON 格式。
命中质量：搜索结果中包含搜索命中的最低分数。 最大。点击数：搜索返回的最大点击数。 Max.记录数：搜索返回的最大记录数 Max.每条记录的点击数：每条记录的最大点击数。
使用筛选器下拉菜单选择您想要包含的峰类型（化合物、人工物、杂质、溶剂等）和您想要排除的峰标志类型（隐藏、弱、旋转、易变等）。选中适用的复选框以考虑匹配的 "峰类型 "和/或 "峰标志"。只需选中适用的方框，就可以将筛选范围限制在可见范围内。
在 "公差 "部分，您可以选择峰位置的搜索公差（绝对值）。
强度和宽度都是乘法容差，例如，如果容差宽度值为 0.8，而峰值查询的宽度值为 5，那么如果数据库中峰值的宽度值在 5-0.8*5 和 5+0.8*5 之间（即 1-9 之间），就会出现搜索结果。公差值为 1.0 的情况属于 "特殊情况"，为了得到匹配结果，强度和宽度将被忽略。
-从文档中选择：如果文档中有多个数据集，则从文档中选择波谱。
点击 "OK（确定）"按钮后，峰值搜索将开始运行。在下面的示例中，我们获得了化合物编号 25 的匹配结果，得分为 1000（最大值）：
峰值搜索功能（无论是否结合验证插件）对于识别数据集中的杂质非常有用。
请注意，您也可以在不加载任何波谱的情况下使用 "峰值搜索 "功能。在这种情况下，您需要在表格中输入您希望在数据库中找到的峰值信息：
另外，您也可以使用 "峰值搜索 "功能从分子结构中进行赋值：
如果您的波谱中包含多个化合物，您可以只对其中一个化合物进行峰搜索：
多重搜索 要搜索多重化合物，您只需打开具有所需多重化合物分析的波谱，然后选择 "多重化合物 搜索"（在波谱窗口上单击右键）：
随后将显示查询编辑器，您可以选择要搜索的多重谱点。该对话框与 "峰值查询编辑器"（如上所述）类似
波谱搜索 波谱搜索可在数据库中查找与查询波谱 "相似 "的波谱，完全基于波谱曲线的形状。
请注意，这并不是在数据库中查找波谱的最佳或推荐方法。我们建议对保存到数据库中的任何波谱以及查询波谱进行严格的峰值分析，然后使用数据库/峰值搜索来识别相似波谱。
波谱搜索下的方法是试验性的，仅适用于无法进行全面峰值分析的特殊情况。
以下是可用的相似度测量方法：
- 余弦相似度：两个向量夹角的经典余弦值。默认参数 30 指的是用于查询的箱数。数值越大，分辨能力越强，但速度越慢。 - 斯坦宁（Stanning）：一种计算两个一维波谱之间距离/相似度的数学方法，比较两个波谱曲线下的面积。 - 树状相似性：一种基于树的方法，用于测量 NMR 波谱之间的相似性。
MS 搜索 如果您在 Mnova 中加载了 MS 数据集，并选择 "数据库/MS 搜索"（或右键单击/MS 搜索），应用程序将在数据库中查找这些 MS 峰。
选择 "MS 搜索 "功能后，将显示查询编辑器：
在这里，您可以更改视图（预览或纯文本），或选择批量项目搜索的容差。
最后，点击确定按钮，等待结果：
对于 MS 搜索，我们建议使用搜索结果（MS）视图，通过该视图您可以比较查询结果和匹配 结果，并可使用缩放工具栏轻松放大、缩小或同步保留时间范围：
注意： MassItem 中的数据库定义将包括以下信息：RT、扫描、类型、高度、面积、总高度百分比、总面积百分比、开始时间、结束时间，适用于每次色谱运行中与该特定质量项相对应的每个色谱峰。数据库定义最多可容纳 8 个痕量（TIC、全紫外（或 DAD 或 PDA）、ELSD、CNLD + 4 个特定波长的紫外痕量）。
MS + 分子质量搜索 质谱+分子质量搜索可让您运行质谱和分子质量值的组合查询。
保留时间搜索 保留时间搜索 "允许用户输入一系列保留时间，并选择在 DB 的 "RT"、"开始时间 "或 "结束时间 "字段中的 "Itemtype MassItem "内工作。
猫王搜索 使用此选项可通过 "余弦"、"斯坦宁 "或 "树相似性 "方法搜索您的紫外、红外或拉曼数据集：
数字和文本搜索 您只需选择其中一个选项，即可搜索数据库中的数字或任何文本：
请注意，数字搜索可以包含 "10 < 20 "或 "10.2 <= 20.5 "这样的范围 。
要搜索数据库中的所有项目，请在搜索对话框中输入"-"（不带引号）。
请注意，在默认情况下，文本搜索将是精确和区分大小写的，而选中子串复选框则可以根据数据库后台情况进行区分大小写或不区分大小写的搜索。
高级搜索 该选项允许你将多个查询（在同一文档中）组合在一起进行搜索。在下面的示例中，您可以看到我们如何将一维和二维 NMR 数据集的峰值与质谱结合起来。
您可以查找 3 个查询中的任意一个（在适用的下拉菜单中选择"OR"），也可以查找所有查询（选择 "AND"）。您还可以加载/保存 XML 格式的组合查询，或使用对话框中的相应按钮添加/删除/编辑查询。
设置可指定如何将子查询的搜索结果合并为高级查询的单一结果。
设 A 为子查询 a 返回的结果，B 为子查询 b 返回的结果。那么，当组合器 ="AND "时，score(R) = min(score(A), score(B))当组合器 ="OR "时，score(R) = max(score(A), score(B))
当组合 = 记录时，A 和 B 必须是同一记录中的匹配项，子查询结果才能合并。 在组合 = 项目的情况下，A 和 B 必须是同一项目（在同一记录中）产生的匹配结果，这样 A 和 B 才能出现在最终结果中。
因此，在您的高级查询中，例如子查询 a="1D 峰值>2"，子查询 b="1D 峰值<3"，当您选择组合器 "记录 "时，您将得到匹配记录，这些记录可能包含一个 1D 峰值为 5 的毫秒项（5>2，匹配 a）和另一个 1D 峰值为 1 的毫秒项（匹配 b）。当您选择组合器 "项目 "时，这些匹配项将被排除，因为 A 和 B 必须出现在同一个项目中，匹配项才会出现在最终结果中，因此您只会得到两个条件都成立的项目，即 1D 峰值>2 和 1D 峰值<3 的毫秒项目。
如果您想组合不同项目的条件，组合器 "Records "非常有用，例如：搜索分子名称中出现 "Methyl"（甲基）且 NMR 波谱的 1D 峰值在 1 和 3 之间的记录。
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