Peak Detection (Integration)

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Peak Detection (Integration)

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通过菜单 "质量分析/峰值检测 "或使用工具栏上的相应图标,可将 TIC 色谱图中的所需峰值与 Mnova MSChrom 集成:

 

峰值检测

 

在 "峰值检波 "菜单下有几项功能:

 

检测峰值: 对 TIC 进行自动峰值检测。

 

Detect Peaks Options 检测 选项 您可以在此选择峰值检测算法(默认为增强算法),还可以自定义用于自动检测的峰值最小面积阈值。

 

增强型

 

最大峰底宽度是一种滤波器,用于剔除峰底宽度(x.end() - x.start())大于阈值的峰。

阈值可以是绝对值(以分钟为单位),也可以是色谱总时间的百分比。

点击 "更多 "按钮可选择其他高级选项,如灵敏度、峰基线、平滑、萨维茨基-戈莱、重叠灵敏度、饱和度和基线校正。

增强型 MS 峰值检测

 

峰值基线:通过下拉菜单可以选择 "拟合 "或 "绝对"。拟合 "表示在检测到的峰的边界上建立基线。绝对基线始终使用零作为基线(用于基线校正信号)。无论如何,如有必要,任何峰的基线都会被修改,以确保基线始终低于色谱信号。默认选项为 Fit。

 

萨维茨基-戈雷Savitzky-Golay)选项为 "增强型 "色谱峰检测过程内部使用的所有萨维茨基-戈雷(SG)滤波器(1 次、2 次和 3 次导数)设置窗口大小(以点为单位)。

 

平滑选项使用移动平均滤波器,以定义的窗口大小(点)平滑信号。如果激活平滑功能,萨维茨基-戈莱选项将自动设置为 "自动"。

 

重叠灵敏度:该选项表示不同级别的灵敏度,用于搜索具有良好定义的色谱重叠峰(通过 使用三次导数)。对于噪音较大的色谱图可能效果不佳。

 

overlappingMS

 

高("3rdDerivative"):相当于激活已废弃的 "Sensitive overlap(敏感重叠)"选项。该级别使用 1、2 和 3 次导数搜索重叠峰。

中等("2ndDerivative"):这是默认级别。它使用第 1 和第 2 次导数来搜索重叠峰。相当于禁用已废弃的 "敏感重叠 "选项。

低("1stDerivative"):新的重叠灵敏度级别,只使用 1 次导数搜索重叠峰。该选项可以解决重叠峰过度检测的问题,如下面截图中显示的 "丑陋峰":

 

基线校正: 该选项在峰值检测过程开始前(但在平滑步骤(如果有)之后)对信号进行基线校正。该校正供峰值检测过程内部使用:不会修改色谱图的信号强度。

 

饱和度 级别(SaturationLevel 选项允许您设置一个丰度级别(高度),以识别那些可能已经饱和的色谱峰,并将其排除在结果处理之外。

使用该选项时,所有高于饱和度的色谱点都将从峰值检测过程中移除。因此,这些饱和范围将始终被整合到同一个峰中:饱和范围前后的斜坡和尾部构成的假想峰。

 

值为 0 表示禁用饱和检测("无")。您可以在编辑框中键入该值,或在色谱图中以图形方式选择该值(使用该 铅笔 按钮)。要重置饱和度级别,只需点击相应的按钮即可。

 

质谱峰值表新增了一列 "标志(Flags)":"饱和(Saturated)"标志设置为检测到饱和的峰值(用户不能修改该值)。此外,"饱和 "标签也会添加到这些峰上(该标签可编辑)。

 

一般来说,增强型方法比传统算法能更好地显示检测到的峰的基线。为确保自动检测到所有峰值和峰肩,您需要调整灵敏度或 Savitzky-Golay 平滑参数。

 

选择传统方法后,您可以 自定义自动检测峰的最小区域阈值。您还可以定义要排除的区域,并选择最大峰值宽度(Peak Width at base)。

 

经典峰值检测法

 

灵敏度范围为 0 到 200。一般来说,不应低于 50 或高于 80。

 

平滑窗口大小小于 5 表示根据色谱的噪音水平自动决定平滑窗口。 如果窗口大小不为零,则必须是介于 5 和 151 之间的奇数。

 

肩灵敏度的最大值未知。默认值为 0.1。

 

当设置宽峰标志时,表示相邻色谱峰应合并为一个大峰。

 

您还可以点击下面高亮显示的按钮,在色谱插件中选择峰检测选项:

 

ChromatogramPP

 

添加/删除和清除峰:这些功能用于手动添加或删除 TIC 中的峰,或删除所有峰。

 

请注意,只需点击并拖动楔形块就可以更改任何峰的积分区域。您还可以通过点击红色方块(并拖动)来分割积分峰。

 

积分MS

 

您可以在按住 shift 键的同时移动积分处理程序,自由 移动楔形区域。

 

添加/删除峰值(阈值)

您可以用图形方式添加高于阈值的峰值和删除低于阈值的峰值:

删除峰值阈值

切换中心点频谱:在 MS 频谱的轮廓模式和中心点模式之间切换。

 

轮廓模式

 

用户可以手动调整峰检测设置,指定所需的分辨率来构建中心谱:

峰中心点选项

所有峰值都将在峰值表中列出,通过菜单 "View/Tables/Mass/Mass Peaks"(或点击功能区的 "Show Peaks Table"(显示峰值表)按钮)可以显示峰值表。

您可以通过右键单击峰值标签(或从质量峰值表)为任意峰值添加标签:

峰标签

质谱峰的预定义标签可通过选择 "Setup Peak Labels(设置峰标签)"进行配置。

 

设置标签

您可以通过菜单 "文件/另存为 "并选择 "脚本 "选项,将质谱峰导出为 ASCII 格式:脚本:质谱峰值表(*.csv *.txt)"选项。您将获得 m/z 和相对丰度列表。您可以按照菜单 "工具/导出/质谱峰值(或色谱图的质谱数据)"进行操作。