NMR Tools

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您可以在 "工具/NMR 工具 "菜单下找到几个脚本:

 

NMR_Tools

 

峰值表到频谱

该脚本允许您从峰值表合成 NMR 波谱:

 

峰值表到频谱

 

多倍报告到频谱

从论文中复制的多重报告合成频谱。 更多信息请参见本章

 

赋值到谱图

根据分子赋值合成波谱:

 

赋值 2 频谱

 

选择所需参数后,即可得到合成波谱:

 

assign2spectrum2

 

按原点标注峰值

该脚本可用于了解任何处理过的 NMR 图谱中使用的峰值提取方法:

 

现在让我们看看它是如何工作的。首先加载波谱文件并应用选峰方法。Mnova 会在波谱顶部显示带标签的选峰列表(下图中的红色方块):

 

剪辑 0015

 

然后,按照 "Tools/NMR Tools(工具/核磁共振工具)"菜单应用 "Annotate Peaks by Origin(按来源标注峰值)"脚本。之后,Mnova 将在每个适用的峰标签上标注峰的原点(当波谱有两种或多种不同的取峰方法时非常有用)。您可以在下图中看到使用此脚本的结果:

 

剪辑 0014

 

Mnova 在峰值标签中显示的注释如下:

 

手动阈值(GSD):"手动 LSD 

手动逐峰(GSD):"Manual 

手动阈值(标准):"手动标准 

手动逐峰(标准):"手动 

自动选峰(GSD):"自动 GSD 

自动选峰(标准):"自动标准 

通过加载表格进行 CRAFT 峰值提取:"Auto CRAFT" (自动 CRAFT

 

另请参阅:

峰值提取

 

DEPT 曲线。 参见本教程 处理瓦里安 DEPT 波谱

 

纯度计算器。参见本章

 

设置中心频率。通过输入 f1(1D 波谱)或 f1 和 f2(2D 波谱)的值(单位 Hz),可以设置波谱的中心值。下一次打开对话框时(对话框第一次显示当前频谱的中心值),上次使用的 f1/f2 值将被记住。如果在页面导航器中选择了多个波谱,则输入的值将应用于所有选定的等尺寸波谱。

 

波谱质量评估器。 在自动分析(如验证、qNMR、SMA)过程中,自动检查波谱质量非常有用。该脚本就是这种 "质量检测 "功能。

脚本将用于测试的峰的化学位移作为输入(采集和处理参数、相位误差、半高峰宽、信噪比、纯度和数字分辨率)。如果没有指定峰值,则应使用波谱中最大的化合物峰值(尊重盲区)。

 

光谱质量评估器

 

最后,它会生成并输出每次测试的结果:

频谱质量输出

 

信噪比计算

计算信噪比。脚本将获取噪声电平,然后通过测量峰值高度除以噪声电平计算信噪比。

 

运行脚本后,需要选择一个无信号区域来计算噪声,然后按 "继续"(如果没有应用光栅化,可以跳过这一步):

 

snr_1

 

接下来,选择要计算信噪比的频谱区域(或单个峰值)。计算完成后,程序将在峰值列表表的 "注释 "部分填入信噪比值。

 

计算信噪比的脚本需要两个参数:

1) 噪声值

2) 峰强度

 

然后使用这些参数之间的比率计算信噪比:SNR = Y / 噪音;

 

其中,Y 是峰值振幅,噪声是在频谱无信号区域计算的均方根偏差。

 

噪声值可以手动或全自动计算,具体如下:

 

a) 手动。用户需要在频谱中选择一个 "无信号 "区域,在该区域内根据公式计算噪声:

 

clip0016

其中

N = 无信号区域的点数

Yi= 频谱中每个数字点的数值(实数部分)

Ym= 该区域数字点的平均值(实数部分

 

b) 全自动(与布鲁克公司不同);用户无需选择波谱的任何区域。

 

关于峰强度,脚本是这样使用峰值的:

1.如果用户进行了手动选峰(或逐峰选峰或自动 PP),程序将使用放大区域内的这些峰。

2.2. 如果用户未应用任何 PP,脚本将使用自动 PP 选项为用户在选定区域内应用 PP。

 

SNR 峰值计算器 "非交互式

该脚本允许用户选择噪声区域和感兴趣区域,以获得适用的 "信噪比":

 

SNR_non

 

也可用于 2D:

 

2D_SNR

 

叠加/堆叠波谱

 点击 "工具/核磁共振工具"菜单 中的 " 叠加波谱  "和 " 堆叠  波谱 "选项, 可以 "堆叠或叠加 "所选波谱  。结果不会是真正的堆叠/叠加波谱,取而代之的是堆叠或叠加波谱窗口,允许您自由上下移动,因为每个波谱都是独立的项目:

伪堆叠

导入时自动叠加波谱的脚本。

在菜单 "Tools/NMR Tools"(工具/核磁共振工具)下,您可以找到几个脚本,用于对堆叠图进行自动相位校正:

 

自动相位叠加

 

-当前自动相位,其余相同相位对活动波谱进行自动相位校正,并将得到的 PH0 和 PH1 值应用于堆叠图中的其他波谱。

-与电流同相活动波谱的 PH0 和 PH1 值将应用于堆叠波谱中的其他波谱。

-设置溶剂:用于更改参数表中的 "溶剂" ,以防溶剂错误或丢失。您可以在同一文档中选择多个页面,使用该脚本更改所有页面的溶剂。

 

预测 1H 和 13C "脚本将生成包含给定分子结构预测结果的曲线图(需要 NMRPredict Desktop 许可证):

 

预测 1H 和 13C_2

 

自动附加示踪 "脚本会自动将一维波谱设置为二维波谱的外部示踪(所有波谱必须在同一文档中)。

 

脚本"Make 2D DIAG NMR "将从一维实验合成二维波谱,使后者成为二维波谱的对角线部分。使用 "间接协方差 NMR "获得二维纯移谱可能很有用。更多信息请参阅本文

 

脚本"Split STD " 将分割其 STD 参数集生成的布鲁克伪 2D 文件(只有 2 个增量的特殊 2D 文件)。生成的堆栈将在底部显示参考波谱以及参考波谱与堆栈中其他波谱之间的差异:

 

脚本结果

 

合成纯移位 "脚本会将所有多谱点(使用 GSD 挑峰)转换为单峰(保持化学位移和面积不变)。

 

pureshift

 

Unfold 2D "脚本可用于在二维波谱中分配别离/折叠峰。