First Steps with the MSChrom Plugin

使用 Mnova 的 MSChrom 插件很容易获得第一个结果：

1.将原始文件夹拖放到 Mnova 中，以显示最高信号的 TAC（位于窗口顶部）、TIC（位于中央）和 MS 频谱（可在 "首选项/质量/设置 "中更改默认值）。

2.您可以使用 "放大 "功能来扩展任何刻度（在 TIC 或 MS 中），只需按下 "Z "键或使用工具栏上的相应图标即可访问该功能 .

3.您可以 使用十字准线功能选择特定时间点的任何其他质谱 (按 ESC 键保留所需的质谱图）。例如，在本例中，我们选择了 "保留时间 "为 8.26 分钟的 467 号质谱：

注意： 当您将十字准线悬停在色谱图（或痕量图）上时， "实时质谱预览"首选项 将允许您即时 显示提取的质谱  。 

4.4. 如果您需要平均某一时间范围内的质谱（CoAdd），只需选择十字准线，按住鼠标左键并拖动到 TIC 中适当的时间跨度上即可。质谱顶部的标签会告诉您波谱范围（下图中的红色矩形）：

如果您想 "CoAdd "整个峰值，只需按照菜单 "Mass Analysis/Crosshair/Peak"（质量分析/交叉轴/峰值），最后在 TIC 中选择所需的峰值即可。

要生成不带尾峰的整个峰的 "CoAdd"，只需在 "Mass Analysis/Crosshair "下拉菜单中选择 "Peak (Background Subt.) "模式。

5.点击 "Append（添加）"按钮，即可将另一个质谱添加到页面中。 .接下来，在 TIC 中选择所需的时间跨度，以获取相应的 MS 图谱。

6.分子匹配 "功能非常有用，可以查看质谱和色谱是否与文档的分子结构相匹配。将 TIC 和质谱显示在屏幕上，并在 .mnova 文档中打开一些 .mol 或 .sdf 文件，点击工具栏上的 "计算分子匹配 "按钮 . 将显示 "分子匹配 "表以查看结果。该表将包含有关 "保留时间"、扫描（波谱数）、匹配分数......的信息。

点击任何分子都将显示与 TIC 重叠的 MICC（分子同位素簇色谱）。

此外，Mnova 还会在色谱图中显示匹配的保留时间（蓝色垂直线），并将相应的 MS 图谱与理论图谱重叠显示（本例中为绿色，M/Z 约为 278）。

7. 7. 如果使用的是高分辨率 MS，则可以对质谱的任何峰值进行 "元素组成 "分析。首先，按照菜单 "Mass Analysis/Elemental Composition/Constraints（质量分析/元素组成/约束）"进行操作：

这将打开 "元素组成约束 "对话框：

点击该图标 添加更多 "元素约束"。完成约束后，单击 "元素组成 "图标，用十字准线选择质谱中想要的峰值。结果表格将显示出来（您可以在 "查看/表格 "菜单下找到该表格）。所有得到的结果都将满足成分、DBE 和容差约束条件，并按合适度递减顺序排列。请注意，匹配度值为 1 时为完全匹配。

8. 按照菜单 "查看/表格/参数 "显示并报告 "参数表"：

最后，用户可以保存 , 打印 或导出为 PDF 点击工具栏上（或 "文件 "菜单下）的相应图标，导出文件。